2006年是中超联赛元年，亚泰本赛季获得第四名。 亚泰在2007年夺得中超冠军，但近年来的表现却不佳。 近五年来，利亚泰已3次卷入保级大战。 客队只要打平就可以保级。 然而，这一次他们未能留在中超联赛。
2007年，亚泰夺得中超联赛冠军，主教练高洪波也获得最佳教练奖。 2009年，亚泰在中超联赛中获得亚军，这是仅有的两次好成绩。 本赛季余下的战绩表现一般。 虽然夺冠无望自中超没有降级的球队，但也不用担心降级。 自2013赛季以来自中超没有降级的球队，亚泰已经3次陷入保级大战。
2013年中超最后一轮自中超没有降级的球队，亚泰尽管要看别人脸色，还是险些保级。 除了主场击败辽足之外，他们还不得不寄希望于青岛中能输球。 最终，他们主场1-0获胜，中能获胜。 最终他们也输了，亚泰奇迹般保级。
2016年中超联赛，亚泰在联赛还剩4轮的情况下落后绿城4分。 上轮亚泰主场1-0击败申花，连胜四场，最终反超保级。
2018年中超联赛，亚泰只需要客场战平就可以保级，但最终客场0-2不敌对手，首次遭遇降级。
